短效避孕药由人工合成的雌激素和孕激素配制而成，对一些女性来说，长期服用避孕药可能打乱了体内激素原有的平衡，从而出现一些临床症状，比较常见的临床症状主要有：
一、类早孕反应
类早孕反应较常见，约占用药人数的50%。表现为食欲不振、恶心、呕吐甚至乏力、头晕等类似妊娠早期的反应。常在服药第1～2周发生。该反应与避孕药中的雌激素刺激胃黏膜有关。
二、色素沉着
女性长期服用避孕药其脸颊部易出现黄褐斑，这与避孕药中含有雌激素有关。
三、阴道出血
这与漏服、迟服了避孕药或者避孕药药效不足有关。如果阴道流血发生在月经周期的前半期，常提示雌激素剂量太小；如发生于后半周期，则表明孕激素剂量不够，不足以维持子宫内膜。
四、月经过少或闭经
避孕药可以使子宫内膜发育不全，腺体分泌不足，因此子宫内膜不能正常生长而变薄，致使月经量减少。个别女性因避孕药的抑制作用过度，在停药后不发生撤退性出血，出现闭经。
五、肥胖
避孕药物中某些成分可以引起肥胖：雄激素可以引起食欲亢进或痤疮等，尤其是在服用口服避孕药的前3个月内；雌激素水平升高引起水、钠潴留，因此导致月经后半个周期体重增加；孕激素促进合成代谢，导致体重增加。
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